La storia vuole durante un'epidemia di peste bubbonica che afflisse tutto il nord Italia tra il 1630 ed il 1631, la Repubblica di Venezia indisse una processione di preghiera alla Madonna che durò 3 giorni e 3 notti culminata con la promessa del doge di far costruire un tempio votivo di inimagginabile bellezza qualora la città fosse sopravvissuta a questa indomabile piaga. 

Dopo poche settimane l'epidemia rallentò bruscamente fino ad estinguersi nel novembre 1631, data in cui nel novembre del medesimo anno fu iniziato il primo pellegrinaggio verso la zona della Dogana da Mar, dove venne poi costruita la Basilica della Madonna della Salute.

La basilica fu completata e consacrata il 21 novembre 1687 dopo che il concorso per costruirla fu vinto dall'illustre architetto Baldassare Longhena con un progetto a struttura ottagole coperta da una maestosa cupola.

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